欢迎来到三一文库! | 帮助中心 三一文库31doc.com 一个上传文档投稿赚钱的网站
三一文库
全部分类
  • 研究报告>
  • 工作总结>
  • 合同范本>
  • 心得体会>
  • 工作报告>
  • 党团相关>
  • 幼儿/小学教育>
  • 高等教育>
  • 经济/贸易/财会>
  • 建筑/环境>
  • 金融/证券>
  • 医学/心理学>
  • ImageVerifierCode 换一换
    首页 三一文库 > 资源分类 > DOCX文档下载  

    论文资料-粪便DNA论文:越冬白头鹤种群遗传多样性的初步研究.docx

    • 资源ID:12969259       资源大小:34.50KB        全文页数:5页
    • 资源格式: DOCX        下载积分:2
    快捷下载 游客一键下载
    会员登录下载
    微信登录下载
    三方登录下载: 微信开放平台登录 QQ登录   微博登录  
    二维码
    微信扫一扫登录
    下载资源需要2
    邮箱/手机:
    温馨提示:
    用户名和密码都是您填写的邮箱或者手机号,方便查询和重复下载(系统自动生成)
    支付方式: 支付宝    微信支付   
    验证码:   换一换

    加入VIP免费专享
     
    账号:
    密码:
    验证码:   换一换
      忘记密码?
        
    友情提示
    2、PDF文件下载后,可能会被浏览器默认打开,此种情况可以点击浏览器菜单,保存网页到桌面,就可以正常下载了。
    3、本站不支持迅雷下载,请使用电脑自带的IE浏览器,或者360浏览器、谷歌浏览器下载即可。
    4、本站资源下载后的文档和图纸-无水印,预览文档经过压缩,下载后原文更清晰。
    5、试题试卷类文档,如果标题没有明确说明有答案则都视为没有答案,请知晓。

    论文资料-粪便DNA论文:越冬白头鹤种群遗传多样性的初步研究.docx

    .蚇羇羀莇蝿袀艿莆葿肅膅莅薁袈肁莄蚃肄羇蒄螆袇芅蒃蒅虿膁蒂薈袅肇蒁螀蚈肃蒀蒀羃罿葿薂螆芈蒈蚄羁膄蒈螆螄肀薇蒆羀羆薆薈螂芄薅蚁羈芀薄袃螁膆薃薃肆肂膀蚅衿羈腿螇肅芇膈蒇袇膃芇蕿肃聿芆蚂袆羅芅螄蚈莃芅薄袄艿芄蚆螇膅芃螈羂肁节蒈螅羇芁薀羁芆莀蚂螃膂荿螅罿肈荿蒄螂羄莈蚇羇羀莇蝿袀艿莆葿肅膅莅薁袈肁莄蚃肄羇蒄螆袇芅蒃蒅虿膁蒂薈袅肇蒁螀蚈肃蒀蒀羃罿葿薂螆芈蒈蚄羁膄蒈螆螄肀薇蒆羀羆薆薈螂芄薅蚁羈芀薄袃螁膆薃薃肆肂膀蚅衿羈腿螇肅芇膈蒇袇膃芇蕿肃聿芆蚂袆羅芅螄蚈莃芅薄袄艿芄蚆螇膅芃螈羂肁节蒈螅羇芁薀羁芆莀蚂螃膂荿螅罿肈荿蒄螂羄莈蚇羇羀莇蝿袀艿莆葿肅膅莅薁袈肁莄蚃肄羇蒄螆袇芅蒃蒅虿膁蒂薈袅肇蒁螀蚈肃蒀蒀羃罿葿薂螆芈蒈蚄羁膄蒈螆螄肀薇蒆羀羆薆薈螂芄薅蚁羈芀薄袃螁膆薃薃肆肂膀蚅衿羈腿螇肅芇膈蒇袇膃芇蕿肃聿芆蚂袆羅芅螄蚈莃芅薄袄艿芄蚆螇膅芃螈羂肁节蒈螅羇芁薀羁芆莀蚂螃膂荿螅罿肈荿蒄螂羄莈蚇羇羀莇蝿袀艿莆葿肅膅莅薁袈肁莄蚃肄羇蒄螆袇芅蒃蒅虿膁蒂薈袅肇蒁螀蚈肃蒀蒀羃罿葿薂螆芈蒈蚄羁膄蒈螆螄肀薇蒆羀羆薆薈螂芄薅蚁羈芀薄袃螁膆薃薃肆肂膀蚅衿羈腿螇肅芇膈蒇袇膃芇蕿肃聿芆蚂袆羅芅螄蚈莃芅薄袄艿芄蚆螇膅芃螈羂肁节蒈螅羇芁薀羁芆 粪便DNA论文:越冬白头鹤种群遗传多样性的初步研究【中文摘要】白头鹤是IUCN红色物种名录中的濒危物种,需要加强种群保护遗传学的研究。本文以粪便为研究材料,通过高质量粪便DNA样品的提取,对白头鹤个体(来自3个不同地区即升金湖、菜子湖、鄱阳湖自然保护区)的线粒体基因组控制区序列进行测定和群体遗传分析。(1)以1103bp左右长度的线粒体控制区DNA序列进行分析,获得38条线粒体控制区序列,序列比对后共检测到12个变异位点,定义12种单倍型,其中2种为安徽(菜子湖、升金湖)和鄱阳湖两个种群所共有,10种为各个种群所特有。从Genebank下载两条白头鹤线粒体控制区序列,增加了2种单倍型。白头鹤两个种群总单倍型多样性(h)为0.784,核苷酸多样性()为0.00128,核苷酸差异均数(k)为1.414。(2)安徽种群(菜子湖、升金湖)和鄱阳湖种群的单倍型多样性分别为0.802、0.679,核苷酸多样性分别为0.00143、0.00071,核苷酸差异均数分别为1.572、0.786。相对于鄱阳湖种群,安徽种群(菜子湖、升金湖)的单倍型多样性、核苷酸多样性、核苷酸差异均数相对较高。中性检验和歧点分布检验(SSD=0.00879,P=0.16)均表明白头鹤在历史上发生过种群扩张事件,时间约在17916年前。分子变异分(Analysis of Molecular Variance, AMOVA)的结果表明白头鹤的遗传变异99.40%发生在种群内,种群间的遗传差异只有0.6%。种群遗传分化不明显Fst=0.00600(P>0.05)。从系统树上也可以进一步说明这两个种群间没有出现显著的遗传分化,两个种群间存在基因交流,存在共享单倍型,这种单倍型的存在可能源于古老单倍型,也可能是群体近期分歧或者群体间存在一些基因流所产生的。【英文摘要】Hooded Crane Grus monacha is a threatened species on the Red List of IUCN and their population is still in decline due to habitat loss. It is necessary to study the genetic diversity for effective conservation of the bird. In this study, faeces samples from three lakes, Shengjin Lake, Caizi Lake and Poyang Lake were collected for genetic analysis. The results show as fellow.(1) A total of 1103 base pairs bp of the mitochondrial control region from Hooded crane collected from two lakes in Anhui(Caizi Lake, Shengjin Lake) and Poyang Lake in Jiangxi Province were sequenced.38 control region sequences were obtained. In 38 control region sequences,12 variable sites were determined and 12 haplotypes were identified, of which two haplotypes were shared by all populations, 10 haplotypes were unique for single population. Combining with the two sequences obtained from GeneBank,2 haplotypes were identified. Haplotypes diversity(h) of all populations was 0.784, nucleotides diversity() was 0.00128, and average number of nucleotide differences(k) was 1.414.(2) Haplotypes diversity(h) of populations in Anhui and Poyang were 0.802 and 0.679, nucleotide diversity () were 0.00143 and 0.00071 respectively, while average number of nucleotide differences(k)were 1.572 and 0.786 respectively. In these populations, haplotypes diversity, nucleide diversity and average number of nucleotide differences were higher in the Anhui population than in the Poyang population. Neutrality test and mismatch distribution analysis(SSD=0.00879, P=0.16) revealed a significant population expansion sign in the Hooded crane population, which happened in about 17916 year ago. Analysis of molecular variance(AMOVA) revealed that 99.4% of the variation was within populations, while among populations was only 0.6%. The genetic variance was not significant (Fst=0.00600, P>0.05), as was also indicated in the phylogenetic tree. Gene flow was identified between the two populations, which shared haplotypes. The haplotypes may result from the presence of ancient haplotypes, or differences between groups in the near future, or gene flow among populations.【关键词】粪便DNA 白头鹤 遗传多样性 线粒体【英文关键词】Faecal DNA Grus monacha genetic diversity mitochondrial DNA【目录】越冬白头鹤种群遗传多样性的初步研究 摘要 3-4 Abstract 4-5 目录 6-8 第一章 引言 8-17 1 濒危水鸟保护遗传学的研究概况 8-12 1.1 遗传多样性对于濒危物种种群维持的意义 8-9 1.2 保护遗传学的研究方法 9-12 2 白头鹤种群现状及保护遗传学概况 12-16 2.1 白头鹤的种群现状 12-13 2.2 白头鹤保护遗传学研究概况 13-15 2.3 越冬白头鹤种群保护中存在的问题 15-16 3 本研究的目的、意义 16-17 第二章 研究方法 17-23 1 材料和方法 17-21 1.1 实验材料 17-18 1.2 实验方法 18-21 2 数据分析 21-23 2.1 数据整理 21-22 2.2 序列变异和单倍型 22 2.3 中性检验和种群扩张 22 2.4 种群遗传结构 22-23 第三章 研究结果 23-39 3.1 基因组DNA的PCR扩增结果 23-25 3.2 基因组测序结果 25-28 3.3 线粒体控制区序列变异及遗传多态性 28-39 第四章 讨论 39-45 4.1 白头鹤种群遗传多样性分析 39-41 4.2 白头鹤种群历史动态分析 41 4.3 白头鹤两地理单元遗传多样性分析及保护对策 41-42 4.4 硫氰酸胍改进法提取粪便DNA的优点 42-43 4.5 粪便DNA提取的影响因素及消除措施 43-45 第五章 结论 45-46 参考文献 46-59 致谢 59-60 攻读学位期间发表的论文目录 60 螈肀膁薀螇膂莆蒆螆袂腿莂螅肄蒅莈螅膇芈蚆螄袆蒃薂螃罿芆蒈螂肁蒁莄袁膃芄蚃袀袃肇蕿衿羅节薅衿膈肅蒁袈袇莁莇袇羀膄蚅袆肂荿薁袅膄膂蒇羄袄莇莃羃羆膀蚂羃肈莆蚈羂芁膈薄羁羀蒄蒀薇肃芇莆薇膅蒂蚅薆袅芅薁蚅羇蒁蒇蚄聿芃莃蚃膂肆螁蚂羁节蚇蚁肄膄薃蚁膆莀葿蚀袅膃莅虿羈莈蚄螈肀膁薀螇膂莆蒆螆袂腿莂螅肄蒅莈螅膇芈蚆螄袆蒃薂螃罿芆蒈螂肁蒁莄袁膃芄蚃袀袃肇蕿衿羅节薅衿膈肅蒁袈袇莁莇袇羀膄蚅袆肂荿薁袅膄膂蒇羄袄莇莃羃羆膀蚂羃肈莆蚈羂芁膈薄羁羀蒄蒀薇肃芇莆薇膅蒂蚅薆袅芅薁蚅羇蒁蒇蚄聿芃莃蚃膂肆螁蚂羁节蚇蚁肄膄薃蚁膆莀葿蚀袅膃莅虿羈莈蚄螈肀膁薀螇膂莆蒆螆袂腿莂螅肄蒅莈螅膇芈蚆螄袆蒃薂螃罿芆蒈螂肁蒁莄袁膃芄蚃袀袃肇蕿衿羅节薅衿膈肅蒁袈袇莁莇袇羀膄蚅袆肂荿薁袅膄膂蒇羄袄莇莃羃羆膀蚂羃肈莆蚈羂芁膈薄羁羀蒄蒀薇肃芇莆薇膅蒂蚅薆袅芅薁蚅羇蒁蒇蚄聿芃莃蚃膂肆螁蚂羁节蚇蚁肄膄薃蚁膆莀葿蚀袅膃莅虿羈莈蚄螈肀膁薀螇膂莆蒆螆袂腿莂螅肄蒅莈螅膇芈蚆螄袆蒃薂螃罿芆蒈螂肁蒁莄袁膃芄蚃袀袃肇蕿衿羅节薅衿膈肅蒁袈袇莁莇袇羀膄蚅袆肂荿薁袅膄膂蒇羄袄莇莃羃羆膀蚂羃肈莆蚈羂芁膈薄羁羀蒄蒀薇肃芇莆薇膅蒂蚅薆袅芅薁蚅羇蒁蒇蚄聿芃莃蚃膂肆螁蚂羁节蚇蚁肄膄*;

    注意事项

    本文(论文资料-粪便DNA论文:越冬白头鹤种群遗传多样性的初步研究.docx)为本站会员(scccc)主动上传,三一文库仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对上载内容本身不做任何修改或编辑。 若此文所含内容侵犯了您的版权或隐私,请立即通知三一文库(点击联系客服),我们立即给予删除!

    温馨提示:如果因为网速或其他原因下载失败请重新下载,重复下载不扣分。




    经营许可证编号:宁ICP备18001539号-1

    三一文库
    收起
    展开