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    第五章遗传信息的表达.ppt

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    第五章遗传信息的表达.ppt

    1,第五章 遗传信息的表达,2,中心法则:,第一节 转录(transcription),以为模板合成的过程,3,4,(4)模板: 复制: 两条全部DNA分子; 转录:一条DNA分子的部分,与复制的相同之处:,(1)都以DNA为模板.,(2) 都以nt 为原料,合成方向都是53.,(3) 都服从碱基配对原则,不同之处:,(1)四种原料不同: DNAdNTP, RNANTP,(2)配对碱基不同:A=T;A=U,(3)酶不同: DNA聚合酶;RNA聚合酶,5,一、原核生物RNA的生物合成,(一)RNA聚合酶(RNA polymerase) : 1 种,RNA合成的错误率为10-6 (DNA合成的错误率为10-9-10-10),大肠杆菌中:,全酶为:五聚体(2): :识别结合启动子 2:启动子上游 :催化形成二酯键 :酶与模板的结合部位,需Mg2+,Mn2+, 无校对功能,6,(二)转录模板,基因1:链2:转录模板链(template strand) or 反意义链(antisense strand) 链1:信息链or 有意义链(sense strand) or 编码链(coding strand) 基因2: 链1:转录模板链(template strand) or 反意义链(antisense strand) 链2 为信息链or 有意义链(sense strand) or 编码链(coding strand),7,(三) 转录过程,1、起始阶段: 不需要引物, 全酶中识别并结合启动子 DNA构象发生变化 RNA聚合酶催化两个相邻的nt与模板配对 第一个nt为5pppG or pppA, 第二个nt有游离3-OH 继续加入NTP,延长 几个nt之后 因子脱落,全酶-DNA- pppGpN-OH 称为起始复合物,8,2、延长阶段: 核心酶(core enzyme) 沿模板35滑行, RNA按53方向合成 12nt, RNA 5端与DNA模板脱离 mRNA: 45nt/sec, rRNA: 90nt/sec,3、.终止阶段,两种方式: 因子不依赖终止 因子依赖终止,9,RNA酶行进到模板的终止子部位(富含GC,可在RNA 上形成发夹结构) 发夹结构影响RNA酶的行进 RNA链先从DNA上释放,再与核心酶分离 终止转录,(1)因子不依赖终止 图5-1,10,因子与RNA聚合酶结合(终止子) 使RNA-DNA杂交体解开 因子、RNA聚合酶与DNA分离 转录终止,(2)因子依赖终止 图5-2,11,12,(四)、转录后加工,初级转录产物(primary transcrips):一个操纵子转录出的一条完整RNA。,mRNA:不需要加工 rRNA:需加工、修饰 tRNA:需加工、修饰,6个基因: 3个tRNA 16s rRNA 23 s rRNA 称为30 s RNA 5 s rRNA 间隔序列,如大肠杆菌 rrnD操纵子 (rRNA、tRNA混排)图5-3,13,14,30 s RNA 核酸内切酶(RNase P) 16 s 、23 s 、5 s rRNA前体 + tRNA 前体 (内、外切酶) (1) 剪切作用:多余序列 切除原间隔序列 (2)添加和修复3端CCA序列 (3)某些碱基的化学修饰 成熟16 s 、23 s 、5 s rRNA 成熟tRNA,15,二、真核生物RNA的生物合成,(一)RNA聚合酶,pol 1 :核仁:5.8S、18S、28S rRNA pol 2:核浆:mRNA pol 3 :核浆:tRNA,(二)转录单位: 为一个基因(一个结构基因加相应调控元件),三、转录过程:,16,1起始阶段:需一些蛋白质参与,称转录因子(transcrption factor,TF) (1) mRNA前体的转录 图5-4 :pol 2 TF2D(含一个TATAbox 结合蛋白(TBP)和多个TBP结合因子(TAF) + TATA box TF2A,TF2B结合TF2D TF2F+ pol2 结合TF2B TF2E、TF2H加入,形成起始复合物,17,18,人基因:核心启动子 + 上游调控元件(UCE) 转录因子: 上游结合因子(UBF1)、 选择因子1(selectivity factor1,SL1) (含一个TBP 和 3个TBP结合因子),(2)rRNA前体的转录 :pol 1,UBF1与核心启动子和UCE 结合 SL1与UBF1结合 pol 1与 SL1 中的TBP结合 起始转录,19,20,基因:A box、B box TF 3 C结合与B box TF 3 B结合与启动子 pol 3进入,(3)tRNA、5SrRNA:pol 3,21,3、终止阶段:机制不清,2、延长阶段:与原核生物相似,方向53,22,7mG:5-5磷酸二酯键(正常:3-5磷酸二酯键),(四)转录产物的加工,5端加帽子,1mRNA前体的加工:,3端加尾巴(poly A),去除内含子拼接外显子,(1)5端加帽子(capping)图5-5,1 型帽子结构:m7G-nt1(2-OH被甲基化) 2型帽子结构: m7G-nt1(2-OH被甲基化)- nt2(2 -OH被甲基化),两种:,23,(2)3端加尾巴(poly A tail)图5-6 mRNA中 AAUAAA序列被核酸内切酶识别并在其下游11 nt -30nt 处切断, 在poly A聚合酶作用下加入poly A.,24,(3) 去除内含子拼接外显子(splicing): 图5-7,剪接反应: 在剪接体(spliceosome)中进行 (两步) SnRNA: U1, U2,U3U6 蛋白质,内含子的结构: 5GU-A-AG 3,(5剪切位点) (分支点) (3剪切位点 ),第二步: 5外显子攻击3剪接位点,两个外显子拼接,同时释放套索状中间产物.,第一步: 分支点A 攻击5侧剪接位点G, 释放5外显子.,25,mRNA内含子的自我剪接,26,特点:内含子自我剪接 / 核酶,产物:套索结构,(4)化学修饰: 主要是甲基化修饰,(5)RNA的编辑(RNA editing),隐蔽基因(cryptogene) 产物 如 线粒体细胞色素氧化酶C亚基mRNA: 在145个不同位点插入407个U, 在9个不同位点删除19个U, 编辑nt占成熟mRNA的一半以上。,27,(2)tRNA 前体的加工,A:tRNA 前体的剪接:去除内含子和5侧先导序列。 B: 添加或修复3端CCA序列。 C: 化学修饰:形成稀有碱基。,(3)rRNA 前体的加工: A:rRNA 前体的剪接; B:化学修饰,28,第三节 翻译,一、原核生物蛋白质的生物合成,(一)蛋白质生物合成体系,1、mRNA : (1)密码子(codon):每三个相邻的nt决定一个氨基酸。 (2)开放阅读框(open reading frame,ORF):从起始密码子到终止密码子。,29,(3)遗传密码:64个密码子的统称。密码子表( P78),(1)起始密码子:AUG- met; (2)终止密码子:UAG,UAA,UGA (3)读写方向: 53; (4) 连续性; (5)兼并性:几个密码子决定同一个氨基酸; (6) 通用性;,特点:,(7)摆动性(wobble):密码子的第三位与反密码子的第一位 碱基的配对不十分严格。,30,31,主要活性部位: A位(受位acceptor site):氨酰tRNA(tRNA-a.a)进入的部位. P位(供位 donor site,peptide site): 肽酰tRNA(tRNA-a.a-a.a-a.a-a.aa.a) 占据的部位.,2核糖体(ribosome):rRNA + prs :是蛋白质合成的场所,3tRNA:氨基酸的运输工具, 细菌中约30种-40种。,4各种蛋白质:起始因子:IF:IF-1;IF-2;IF-3。 延伸因子:EF:EF-Tu;EF-Ts;EF-G。 终止因子:RF:RF-1;RF-2;RF-3。,32,5氨基酰-tRNA合成酶:催化氨基酸与tRNA结合形成tRNA-a.a, 具有特异性.,1.起始阶段: IF-3+ 30S mRNA fmet-tRNAfmet-IF-2-GTP(IF-1促进该三元复合物形成) 50S 释放IF-1,IF-2,IF-3,GDP,Pi 形成70S.mRNA. fmet-tRNAfmet 三元起始复合物.,(二)氨基酸的活化: tRNA + a.a tRNA-a.a,(三) 翻译过程: 三个阶段,33,34,2.延长阶段: 许多循环组成,每个循环包括三步,(1)进位::甲硫氨酰-tRNA首先进入P位( 由起 始密码子AUG编码)此后的所有aa-tRNA都首先进入A位. (2)转肽:肽键形成 (3)移位::A位 P位.,35,3 终止阶段: 当进入终止密码子时.,36,二、真核生物蛋白质合成的特点 : 与原核生物基本相同,1肽链的折叠 2各种共价修饰 3水解修饰 4亚单位聚合,三、肽链的翻译后加工,37,修饰水解,成熟的分泌蛋白,高尔基体中切除部分肽段/修饰,蛋白原,

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