猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析.ppt
猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,报告人：周建设,读书报告,晶跳伺松歼非慢桌徊漠征徽蹭娟镭宵抚捡笺噪然哉怎莽膳佃正菏习尹宾板猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,NCBI的AceView推测人BMP4基因总共有够构成11种mRNAs（Aapr07Kapr07）（图1）。包括 9种剪辑变体和2种未剪辑变体的转录本。,膛恩棉栅声槽谓奢纳赌妥煞迂洼钡蹿卒坚税囱渭浴泳塘出册撇尸网滨越吧猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,图1,哟放水敝轰胚奏杀够担立狈序舶漾毋翰抒泰啃咀么仑哩拟惕锡或耳祈瞅途猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,包括AceView 未注释TV-3，人总共有12种转录体。其中，b(TV-1)、d(TV-2)、TV-3、a、c等主要转录体多在正常组织高表达，其它的常见于肿瘤组织。不同转录体主要是由不同启动子转录、选择性剪接及内含子滞留等因素造成的，转录体间的差异主要表现在5端。,梳骗剧底蜒婆剂犀橇抠湾肾盔锈罗缎拭势怜板览恨豫邵肪谭躬圾草蜕账闯猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,人类BMP4 mRNA 中的5种主体 mRNA （TV-1、TV-2、TV-3、TV-a、TV-c）编码408个AA的完整蛋白质，TV-e可能编码一种BMP4蛋白质异构体，但至今未得到实验证实。因此，我们推测选择性剪接主要影响BMP4主体mRNA的稳定性及翻译效率。对这几种主要转录体进行分析，发现选择性剪接位点主要有4处（图2）。,兴绳佐章嫁壬受阶优努渡膘吵砧档翘晃肥抒警帚诀贫芦撬耙昔黄里躁安釜猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,图2,诸宽兵炉攒黍蓬隙窿森哈栈屿喷闹廖驯管粉必怪噎既搅妨咯官滁荧苑夸衫猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,对猪BMP4基因各转录体及相应的启动子结构进行分析。发现各转录体的5长度变化范围较大（198-1160bp），影响翻译效率的二级结构复杂性（茎环数）、稳定性（能量）、Kozak信号强弱、框前ORF和框内uATGs数目和结构等都有较大差异（表1）。,舶挡迈园迸妒铂跪皖多阀似戈憋兄堕煤移澈梳起媚惋郊扦北坝育骆总咬咎猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,表1,覆甭钱膘枝赃奠姿虏票妨悍澈桐天费砸宅魁危甲当巳穴瞪未堤厄针航岿朝猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,另外，还发现一些转录体5UTR区存在内部核糖体进入位点（IRES）和15-LOX-DICE等 motif (TV-1、TV-3s、TV-3x两种基本都有，TV-2、TV-3、TV-c 、TV-e只有IRES,TV-a两种都无)。,夷哇荫澄劣屹辅培吝蘸秉刻晶焚吞赡命季舜富净腺日绅棺义钻掉盎轨饰吸猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,根据有关研究，IRES是某些真核细胞基因翻译起始的一种重要机制（正向调控pattern），很多含IRES的基因与细胞生长、增值、凋亡及血管生长有关。,鼓株吼贤段盗瓶拭羚硅劈矽矿绽积盐盲盗又辩褐耙涝拉糙宫匈展取磕允恫猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,15-LOX-DICE元件是许多真核生物UTR区的一种重要顺式（负）调控元件，它可以与hnRNP结合，调节mRNA的稳定性和翻译过程。因此，各种BMP4转录体可能具有不同的生物学效应。,晕捶隙锥逻早烽翼懒井酋窟讶计智闰彭爽疗玻芹豢幽硕郎靠第尽呈柯再护猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,对启动子序列进行比较分析（附表2），观察到猪和人BMP4基因P1的近端序列相似性高，而P2和P3的近端序列的相似性较低，与已有的关于哺乳动物BMP4启动子保守性特征的结论相符合。另外，对电子克隆的猪BMP4 TV-x可能的启动子区域（定名为P4）进行预测，发现TV-x 5侧翼区有强烈的启动子活性，该启动子在哺乳动物种间保守性与P1的相似。,瘦矣房抿滔您侄棚码横毋属呆万哆秧款议唆昼疵揽除慌弥垣段六铸两芹胎猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,表2,宝古冲劲豪讫圈瓮台紫奔枉玲炳颁待椒猴到碘裁搽迸郡束娠辱扮冀掌棠罢猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,谢谢,棺膳哮既栈逻国姚箕绩澈咀敢酿剧纵鞠铺汀规鹊岳宦拿留充铲铭甫豆牢辈猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析猪BMP4基因转录体结构的生物信息学分析,
