基础生物化学 复习总结2010.ppt

,研究生命的化 学本质,物质基础,（代谢）,功 能,有机小分子、无机离子 生物大分子（多糖、脂、 核酸、蛋白 酶 ）,组成元素组成、结构组成 分布胞内、胞外 结构一级（化学）结构 高级（空间）结构 性质一般化学性质、光学性质 物理化学性质 生物学活性（变性、复性）,物质代谢 （同化、异化）,代谢途径（分解、合成）物质能量衍替,代谢调控（限速酶）,核 酸（53 ）,磷酸,碱基（Py/Pu）,(2-脱氧)核糖,(稀有) 核苷,A/G/C/T（U）,核苷酸,核酸(ABZ型）,DNA,3,5-磷酸二酯键,甲酸盐、 CO2 Gly、 Gln Asp、Ser 氨甲酰磷酸,复制,逆转录（逆转录酶）,不对称转录（RNA聚合酶）,自我复制 （RNA复制酶）,半不连续复制,半保留复制,DNA聚合酶 原： 真：(核心),PRPP,原：2(核心） 真：,胞质溶胶,细胞核/细胞器,RNA（mRNA rRNA tRNA）,碱基分解在三个水平上 核苷酸转化在不同磷酸水平上,核 酸 酶,蛋 白（NC ）,氨基酸,多肽链,氨基酸、核糖体、mRNA、tRNA、辅助因子（Mg2+、IF、EF、RF）,氨基酸活化,终止和释放 延伸 合成起始,翻译后加工运输,蛋白,NH3,氨同化,转氨基作用 氨基酸转化,Glu 氨甲酰磷酸,生物固氮 NO3还原 含N有机物 分解,合成氨基酸 铵盐 酰胺 尿素,酮酸,氧化分解、生成氨基酸或糖和脂,氨基酸脱氨、糖分解、植物光呼吸,PyrAla族 乙醛酸、PGASer族 草酰乙酸/延胡索酸Asp族 -酮戊二酸Glu族 Ru5PHis E4p、PEP芳香族,氨基酸/肽段切除 特征序列添加 共价修饰 折叠,一碳转移,脱氨基（氧化转氨联合非氧化脱酰胺）,胺,（羟化直接）脱羧基,（ATPAMP）,（GTP）,（GTP）,核酸和蛋白的比较,基本结构单位 核苷酸 氨基酸 一级结构及其 53 N C 作用力 3,5-磷酸二酯键 肽键 二级结构极其 B A Z -螺旋 -折叠 -转角 无规卷曲 稳定的作用力 碱基堆积力 氢键 氢键 离子键 高级结构及其 超螺旋 三、四级结构 作用力 氢键 次级键（盐键 氢键 二硫键 疏水作用） 紫外吸收 碱基共轭双键 芳香族共轭双键（Trp Tyr Phe） 260nm 280nm 变性 二级结构破坏，双螺旋变单链 空间结构（包括二级）破坏 合成 细胞核（真核） 细胞液,核酸 蛋白,氧、转、水、裂、异、合,S,氧化脱羧、 非氧化分子重排,己糖磷酸化 磷酸己糖裂解 丙酮酸生成,CH2O-P CH2 CH2 CH2 CH2 CH2O-P,CH3 CH2 COOH COOH CH2 CH3,Glc,PGA,Pyr,CH3（CH3） CHOH COOH,乳酸,CH3 （CH3） CH2OH,乙醇,+ CO2,乙酰CoA,+ CO2,草酰乙酸,CH2COOH CO-COOH CH2-COOH,柠檬酸,CO2,CO2,糖分解代谢中碳原子去向,（肝脏/油料种子萌发）细胞质,脂肪,乙酰CoA,脂肪,类脂（磷脂）,脂肪酸合成酶系,甘油,脂肪酸,脂肪酸活化转运 、-氧化,脱氢 水合 脱氢 硫解,还原（烯脂酰ACP脱水酶） 脱水（ 羟脂酰ACP脱水酶） 还原（ 酮脂酰ACP还原酶） 缩合（-酮脂酰ACP合酶）,丙二酸单酰CoA,乙酰CoA羧化酶,胺,衍生物,脂肪链合成 乙酰CoA羧化 乙酰CoA转运,从头合成胞质溶胶/质体,-氧化线粒体/乙醛酸体基质,代谢调节,神经系统调节 激素调节 细胞水平调节 酶水平调节（最基本的调节） 数量调节（粗调）酶的合成和降解：乳糖操纵子 活性调节（微调）酶原激活 共价修饰（级联放大）：（去）磷酸化 变构调节（前馈激活、反馈抑制单价、二价）：标兵酶 聚合/解聚 辅因子调节（能荷调节、金属离子、NADH/NAD） 定位调节区域化,调节基因：阻遏蛋白 操纵子启动子+操纵基因+结构基因 诱导物（乳糖）、辅阻遏物（Trp）,代谢网络关键中间产物：6-PG、Pyr、乙酰CoA 四级调节：,顺序反馈抑制 协同反馈抑制 积累反馈抑制 同工酶反馈抑制,1、物质: 从来源、组成、性质和生物学功能描述 核酸杂交分子、限制（性内切）酶、核（酸构成）酶、性/平齐末端 粘冈崎片段、先导链和滞后链、Klenow片段 蛋白简单/结合/寡聚球蛋白、必需氨基酸、遗传密码、反密码子 同义密码子、同工受体tRNA 酶 单纯/结合酶、单体酶、寡聚酶、多酶复合体、 变构酶、同工酶 诱导酶和组成酶、端粒酶 生物氧化生物氧化、高能（磷酸）化合物 脂酮体 代谢调节限速酶/标兵酶、信号肽,名 词 解 释,2、结构: 从组成规律、空间分布特点、维持稳定的因素及功能等描述 核酸 一级结构、B型DNA、质粒、断裂（不连续）基因 内含子和外显子、启动子和终止子 蛋白一级结构到四级结构、肽单位（平面） 、 -螺旋 亚基、 SD序列、多核糖体 酶全酶、辅酶/基、活性中心、必需基团 生物氧化电子传递链 代谢调节操纵子,3、变化/过程及调节: 核酸增/减色效应、变/复性、分子杂交、半保留/半不连续复制、逆转录 蛋白别构效应、盐溶和盐析、透析、转/联合脱氨基作用、翻译 酶 可逆抑制和不可逆抑制、竞争/非竞争性抑制、酸碱催化和共价催化 生物氧化能荷调节、底物水平/电子传递链氧化磷酸化、解偶联 糖糖异生、EMP、TCA、PPP 脂-氧化、柠檬酸穿梭、乙醛酸循环 代谢调节前馈激活、反馈抑制、酶原激活,4、性质和规律: 核酸中心法则 生物氧化化学渗透学说 酶诱导契合学说、中间产物学说,5、单位: 核酸熔解温度（Tm） 蛋白等电点（pI） 酶活力单位（U/Kat）、比活力、转换数 生物氧化能荷、磷氧比,1、氨基酸缩写 2、稀有核苷、核苷酸和核酸缩写 Pu Py dTTP cAMP dTTP DHU m7G Cm IMP mRNA rRNA mtDNA ctDNA ds/ssDNA dsDNA cDNA snRNA hnRNA tRNAm tRNAf 3、重要的辅因子和载体 NAD（H） NADP（H） FAD（H2） TPP FMN（H2） THFA（FH4） CoASH GSH/GSSG Cytaa3 CoQ U/A/GDPG ACP BCCP (P)APS SAM PRPP IF/EF/RF CAP 4、重要的单位 Tm pI 5、重要的代谢途径和催化酶 EMP TCA PPP/HMS ETC R/Q/D酶 FAS LDH ATCase 6、重要的物质和专有名词 PEP PITC DNP SSB,Met,fMet,符 号,1、组成和分布 元素组成、基本组分、不同种类的细胞定位 2、分类 按结构组成、按基团性质、按营养结构、按产物种类 3、结构 不同结构层次、不同结构单元、维持结构稳定的因素 4、性质 解离（极性）、旋光性、光吸收、溶解性（沉淀）、变性和复性、显色 简并、配对能力,一、静态：核酸、蛋白、酶、糖、脂,单知识点,1、代谢途径的细胞定位： 分解和合成 2、代谢途径的分类和阶段：电子传递、EMP/TCA/HMS/糖异生、氧化/从头合成 分支代谢途径、共同代谢途径、补救途径(草酰乙酸回补、核苷酸合成） 例：蛋白质合成AA活化、多肽链合成起始、延伸、终止和释放、后加工 3、代谢途径的重要中间代谢产物、关键反应和酶 高能化合物 特殊性质代谢物 共同代谢物 关键步骤 限速酶 4、代谢物的代谢方式：如ADP磷酸化、脱氨/羧基、DNA损伤修复 5、代谢物的来源和去向 6、能量变化： ATP GTP NADH NADPH FADH2,二、动态：核酸、蛋白、糖、脂,单知识点,核酸 熔解温度（Tm）、不对称比率（A+T/G+C） 蛋白含氮量推蛋白含量（16%）、等电点（pI=pKa+pKb/2） 酶 比活力、Km 生物氧化能荷（ATP+0.5ADP/ATP+ADP+AMP）、磷氧比 代谢调节积累抑制效应A+（1-A）X B,1、单位/含量/效应换算,计 算,糖EMP（1Glc2Pyr）有氧：+8/6ATP（2NADH+2ATP）； 无氧：+2ATP 发酵 （1Glc 2乙醇/乳酸）：+2ATP TCA（1乙酰CoA CO2+H2O）：+12ATP （3NADH+1FADH2+1GTP） 1Glc完全氧化分解：38/36ATP 蛋白多肽链合成起始：-1GTP 延伸：-1ATP（活化）+2GTP（进位、移位）：4P 终止：耗能 脂肪酸-氧化活化 ：-2P（1ATP） 氧化：+ 5P /C21FADH2+1NADH 1软脂酸：129ATP； 1亚油酸：142ATP,2、能量代谢,计 算,1、结构特点：B-DNA、蛋白二/三/四结构特点 2、代谢途径的生物学意义：EMP 、TCA、PPP （物质代谢、能量代谢、代谢调节） 3、代谢物的来源、去向、代谢方式和相互转化 氨基酸的NH3和酮酸来源和去向（分解、合成） 蛋白变性的表现（物理、化学、生物学） 脱氨基/羧基作用、四类生物大分子的代谢关系 4、不同代谢途径及其调控的相互比较 竞争性抑制和非竞争性抑制、脂肪酸-氧化和从头合成 真核和原核复制和翻译体系及其功能 真核和原核复制、转录（后加工）、翻译（后加工）比较 5、对调控模型和理论学说的阐述： 化学渗透学说、诱导契合学说 6、举例说明某些重要的性质和结论 生物催化剂特性 遗传密码特性 酶的专一性 蛋白结构和功能的关系 7、生化原理的应用实例 如吃鸡蛋后喝水多 解偶联剂使身体发热,问 答,