西医综合复习生物化学ppt课件.ppt
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1、研究生考试复习生物化学,2,一、生物大分子的结构和功能 蛋白质化学 核酸化学 酶 二、物质代谢及其调节 糖代谢 脂代谢 生物氧化 氨基酸代谢 核苷酸代谢 代谢调节,3,生物大分子的结构与功能,4,第一章 蛋白质化学 大纲要求: 1.组成蛋白质的20种氨基酸的化学结构和分类; 2. 氨基酸的理化性质; 3. 肽键和肽; 4. 蛋白质的一级结构及高级结构; 5. 蛋白质结构和功能的关系; 6. 蛋白质的理化性质(两性解离、沉淀、变性、凝固及呈色反应) 7. 分离纯化蛋白质的一般原理和方法。,5,蛋白质的元素组成,碳(50-55) 氢(6-8) 氧(19-24) 氮(16) 硫(0-4) 其他:磷、
2、铁、锰、 锌、碘等,故:每克样品中蛋白质的含量 每克样品的含氮量 x 6.25,6,1.组成蛋白质的20种氨基酸的化学结构和分类,组成蛋白质的氨基酸只有20种 L型氨基酸,即氨基(或亚氨基)和羧基均与一个碳原子相连。 除脯氨酸为亚氨基外,其余19种均符合通式 除甘氨酸的R为H外,其余均为不对称碳原子。 R基团不同,分子量、解离程度和化学反应性质不同。,7,非极性疏水性氨基酸: 7 极性中性氨基酸: 8 酸性氨基酸:2 碱性氨基酸:3,氨基酸分类,8,酸性氨基酸:2 谷、天冬氨酸 碱性氨基酸:3 赖、精、组氨酸 极性中性氨基酸:8 色氨酸、酪、丝、苏、 半胱氨酸、蛋氨酸(甲硫氨酸) 谷氨酰胺、天
3、冬酰胺 非极性疏水性氨基酸:7 甘、丙、缬、亮、异亮氨基酸 苯丙、脯氨酸(亚氨基酸),9,几种特殊氨基酸,脯氨酸 (亚氨基酸),10,几种特别需要记忆的氨基酸,含硫氨基酸:半胱氨酸(含巯基)、蛋氨酸(甲硫氨基酸) 含芳香环(共扼双键)的氨基酸:色氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸 含羟基的氨基酸:丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸。,11,2氨基酸的理化性质 (1)PI,两性解离 (2)紫外吸收:280nm(色、苯丙、酪) (3)颜色反应、“茚三酮”570nm 蓝紫色化合物,(4)缩合反应:氨基酸与氨基酸缩合成二肽。 肽和肽键 概念:2个氨基酸之间 以酰胺缩合,此酰胺键称为肽键。,概念:是指氨基酸在蛋白质多肽链中的排
4、列顺序,以及它们之间的连接方式。 一级结构是蛋白质空间结构的基础,对生物功能起决定作用。肽键是蛋白质一级结构的基本结构键。有些含有二硫键。 不同蛋白质中氨基酸的种类、数量和排列顺序各不相同,即不同蛋白质具有不同的一级结构。,蛋白质一级结构,13,二级结构: 蛋白质分子中某段肽链,主链骨架原子的相对空间位置。主要包括螺旋、折叠,转角与无规则卷曲。 只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键。 两个或三个具有二级结构的肽段在空间上形成的一个具有特殊功能的空间结构,称Motif ,模序(如锌指结构 )。,14,蛋白质的三级结构是指在二级结构基础上,肽链的不同区段的侧链基团相互作用在空间进一步盘绕、折
5、叠形成的特定格式的三维结构。指一条多肽链的整体构象。 维系这种特定结构的力主要有氢键、疏水键、离子键和范德华力等。尤其是疏水键,在蛋白质三级结构中起着重要作用。,三级结构:,结构域:大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域,折叠得较为紧密,各行使其功能,称为结构域(domain) 。,四级结构: 由二条肽链以上多肽主链构成,每条肽链具有独立的三级结构,每条肽链称为一个亚基,各亚基间以非共价键维系,称四级结构。通常各亚基之间以疏水键,范德华力、氢键、离子键维系。,16,4蛋白质结构和功能的关系 (1)一级结构是空间结构的基础。故一级结构相似的肽与蛋白质,空间构象与功能相似。(
6、分子病:镰刀状红细胞贫血,Hb,链6谷缬,)。,17,分子病:由于遗传物质(DNA)的突变、导致其编码蛋白质分子的氨基酸序列异常,而引起其生物学功能改变的遗传性疾病称 镰刀型红细胞贫血症 正常Hb6 苏 脯 谷 谷 赖 异常Hb 苏 脯 缬 谷 赖 氧分压低时,血中红细胞呈镰刀状,极易溶血,并丧失了带氧能力。,一级结构是蛋白质生物学功能的基础,空间结构与蛋白质功能的表现有关。 蛋白质构象是其生物活性的基础,构象改变,其功能活性也随之改变。(例如:核糖核酸酶) 构象破坏功能丧失。恢复自然构象,功能恢复。 变构作用:凡蛋白质分子因与某种小分子物质相互作用发生构象改变,因而改变了这种蛋白质与其它分子
7、进行反应的能力,这一现象称为。,二、蛋白质的空间结构与功能的关系,19,5蛋白质理化性质 (1)两性解离与PI:,不同蛋白质因氨基酸的种类和数量不同,其等电点也不同。含酸性氨基酸多,pI低;含碱性氨基酸多,pI高;人体蛋白质pI多为5。所以在体液pH值7.4时,对多数蛋白质而言都是碱性环境,则解离成负离子。,(2)沉淀:蛋白质在溶液中析出的现象 蛋白质胶体溶液的稳定因素:水化膜、带电荷 沉淀方法: 盐析法:高浓度的中性盐破坏水化膜,中和电荷使蛋白质沉 淀的过程,称为。如硫酸铵 有机溶剂沉淀:如乙醇等破坏水化膜 某些酸类沉淀:如三氯乙酸等利用酸根结合蛋白质的正离子 成不溶性的盐沉淀。pHpI 加
8、热凝固:加热使蛋白质变性。,21,(3)蛋白质的变性 a.可逆变性;b.不可逆变性。 概念:在某些理化因素的作用下,蛋白质的空间结构(但不包括一级结构)遭到破坏,导致蛋白质理化性质和生物学活性的改变,称为蛋白质的变性作用。 即:肽键没有断裂,分子量未变。,蛋白质变性的特点 1.生物学活性丧失。 2.溶解度降低。 3.易被蛋白酶水解。 4.粘度增加 。,(4)凝固:变性蛋白质再加温,使其在强酸,碱中均不溶。,(5)蛋白质的颜色反应主要与蛋白质的定性、定量测定有关: 茚三酮反应:pr茚三酮丙酮液蓝紫色 双缩脲反应:pr稀硫酸铜紫色 酚试剂反应:pr酚试剂蓝色化合物,24,6分离纯化蛋白质的原理及方
9、法 (1)利用沉淀的性质:(破坏电荷与水化膜) 盐析 重金属盐反应 有机溶剂沉淀、生物碱沉淀 (2)两性游离与PI: 电泳 离子交换层析。 (3)高分子性质: 透析 超离心 凝胶过滤层析,25,A型题,25、在蛋白质的组成中,不含有的天然氨基酸是 A、瓜氨酸 B、半胱氨酸 C、脯氨酸 D、酪氨酸 26、蛋白质变性后的主要表现是? A、分子量变小 B、粘度降低 C、溶解度降低 D 、不易被蛋白酶水解,26,25下列氨基酸中,属于酸性氨基酸的是 A精氨酸 B甘氨酸 C亮氨酸 D天冬氨酸 【分析】 本题旨在考查考生对氨基酸分类的掌握程度。备选项中的甘氨酸和亮氨酸属于非极性疏水性氨基酸;精氨酸侧链含胍
10、基,属于碱性氨基酸;天冬氨酸侧链含羧基,属于酸性氨基酸。故正确答案是D。,27,23 蛋白质变性是由于 A 蛋白质空间构象的破坏 B 氨基酸组成的改变 C 肤键的断裂 D 蛋白质的水解,28,第二章 核酸化学 大纲要求: 1. 核酸分子的组成, 2. 5种嘌呤、嘧啶碱的化学结构,核苷酸。 3. 核酸的一级结构。 4. 核酸的空间结构与功能。 5.核酸的变性、复性、杂交及应用。,29,二、核酸的基本成分,腺嘌呤(A),鸟嘌呤(G) 胞嘧啶(C),尿嘧啶(U),胸腺嘧啶(T),30,DNA是遗传信息的贮存者和携带者,生物体的遗传特征主要由DNA决定;分子量一般都很大;为双链分子。 RNA主要参与遗
11、传信息的表达,它主要通过转录、传递DNA上的遗传信息,将其所得信息翻译成蛋白质;分子量要比DNA小得多;RNA为单链分子。,核酸的生物学功能,腺嘌呤(A)=胸腺嘧啶(T);鸟嘌呤(G)=胞嘧啶(C) A/T=G/C; A+G=T+C; A+C=T+G; DNA的碱基组成具有种属特异性,即不同生物种属的DNA具有各自特异的碱基组成。 DNA的碱基组成无组织或器官特异性,即同一生物体的各种不同器官或组织DNA的碱基组成相似。 生物体内的碱基组成一般不受年龄、生长状况、营养状况和环境等条件的影响。,DNA组成特点 Chargaff法则,1.两条反向平行、走向相反的多核苷酸链围绕同一中心轴相互缠绕而成
12、的右手双螺旋结构。 2. 碱基在内侧,磷酸与核糖在外侧, 3.每两个相邻碱基对平面间距离为0.34nm,螺旋每转一圈的螺距3.4nm,每一圈10个核苷酸。 4.两条链中碱基与碱基横向通过氢键相连配对,纵向借碱基堆积力维持稳定。其中A与T,G与C结合,由一条链通过碱基互补决定另一条链。,DNA双螺旋结构的要点,1 超螺旋结构 2 核小体结构,DNA三级结构,RNA分类及特点,RNA是单链分子。RNA分子中,并不遵守碱基种类的数量比例关系,即分子中的嘌呤碱基总数不一定等于嘧啶碱基的总数。 RNA分子中,单链部分区域自身回折,如果碱基互补也能形成双螺旋结构,不能形成双螺旋的部分,则形成突环。这种结构
13、可以形象地称为“发夹型”结构。 在RNA的双螺旋结构中,碱基的配对情况不象DNA中严格。G 除了可以和C 配对外,也可以和U 配对。不同类型的RNA, 其二级结构有明显的差异。,RNA的结构特点,“帽”:5-末端有一个7甲基鸟嘌呤核苷酸,称 为。加速蛋白质翻译的起始速度,增加mRNA 稳定性。 “尾”:真核细胞mRNA的3-末端有一段长达200个核 苷酸左右的多聚腺苷酸(polyA),称为mRNA。与 mRNA 从核向胞质转移有关。 编码区:mRNA有编码区和非编码区,编码区是所有 mRNA分子的主要结构部分,决定蛋白质分子的 一级结构。非编码区与蛋白质生物合成调控有关。,mRNA分子结构,氨
14、基酸臂:富G,包含tRNA的3和5-末端,3-CCA-OH。直接与活化的氨基酸结合,携带氨基酸。 反密码环:7个核苷酸,正中的3个核苷酸残基称为反密码子。辨认mRNA上的密码子,使所携带的氨基酸正确进入多肽连的合成位点。,tRNA的二级结构,二氢尿嘧啶环(DHU环):811,含有DHU。 TC环:7个核苷酸,有胸苷T、假尿苷和胞苷C得名。 可变环:反密码区与TC区之间,不同的tRNA该区变化较大。,tRNA的二级结构,目前已知的tRNA的三级结构均为倒L型,一般理化性质 高分子性质 紫外吸收 变性、复性与杂交,核酸理化性质及应用,一般理化性质: 核酸分子在酸性条件下较稳定。 DNA粘度大,变性
15、以后粘度变小 RNA粘度小,核酸的高分子性质,分子量大小不同,沉淀顺序不同。可以通过超速离心方法分离。,41,3. 核酸的变性、复性及杂交 变性:在理化因素作用下,DNA互补碱基对的氢键断裂,其双螺旋链解离为单链为DNA变性,通常以热变性为例。DNA的变性并不涉及磷酸二酯键的断裂,其一级结构(碱基顺序)保持不变。,Tm: 由加热使DNA变性时,其变性的紫外吸收值达到最大值50%相对应温度为DNA的解链温度,即Tm,Tm的大小与G+C含量及DNA分子的大小有关。,43,复性:变性的DNA,在适当条件下,两条互补链可重新恢复双螺旋结构的现象。 杂交:不同来源的核酸变性后,一起复性,核苷酸间以碱基互
16、补配对,可形成杂化双链,这一过程为杂交,杂交可出现在DNA之间,也可发生在RNA-DNA之间。,增(高)色效应:天然状态的DNA在完全变性后,紫外吸收 (260 nm) 值升高, 即。,44,核酸分子杂交的应用 研究DNA分子中某一种基因的位置 确定两种核酸分子间的序列相似性 检测某些专一序列在待检样品中存在与否 基因芯片技术的基础,45,A型题,27.下列DNA分子中,可以使Tm值达到最高的是: A、 腺嘌呤和胸腺嘧啶含量为10% B 、腺嘌呤和胸腺嘧啶含量为20% C 、鸟嘌呤和胞嘧啶含量为30% D、鸟嘌呤和胞嘧啶含量为60%,Tm值影响因素: 1 与分子中的G和C的含量有关。G和C的含
17、量高,Tm高(因G- C之间有三个氢键,A-T有两个氢键,故G-C较A-T稳固)。 2 与核酸分子长度有关,核酸分子越长,解链时所需能量越高,Tm值越大,46,164.按照Chargaff规则,下列关于DNA碱基组成的叙述, 正确的是( ) A. A与C的含量相等 B. A+T=G+C C. 同一生物体,不同组织的DNA碱基的组成不同 D. 不同生物体来源的DNA,碱基组成不同,47,24核酸的最大紫外光吸收值一般在哪一波长附近? A . 280 nm B. 260nm C.240nm D.220nm 25核酸变性后,可产生的效应是 A增色效应 B.最大吸收波长发生转移 C失去对紫外线的吸收能
18、力 D.溶液黏度增加,48,第三章 酶 酶的基本概念, 全酶、辅酶和辅基, 参与组成辅酶的维生素, 酶的活性中心, 酶的作用机制, 酶反应动力学, 酶抑制的类型和特点, 酶的调节, 酶在医学上的应用。,49,酶的有关概念 全酶:由酶蛋白与非蛋白部分(辅基、辅酶)组成的结合酶。 辅酶:一类化学性质稳定的小分子物质,它们是组成全酶中的非蛋白质组分,辅酶与酶蛋白的结合疏松,可用透析的方法除去,参与反应时可与酶蛋白分离。,酶是活细胞产生的一类具有催化功能的生物分子,所以又称为生物催化剂。,辅基:多为金属离子,与酶蛋白结合紧密,在反应中不能离开酶蛋白。 活性中心:由酶分子及相关组分中的必需基团组成,这些
19、必需基团在空间位置上彼此接近组成特定的空间结构。,酶的化学本质:绝大多数酶是蛋白质;少数是RNA,如核酶。,酶的种类繁多,辅因子种类少。 一种酶蛋白只能与一种辅助因子结合 一种辅助因子可与多种酶蛋白结合成不同的全酶,催化不同反应,52,维生素与辅酶的关系,维生素A的活性形式是顺视黄醛 维生素D的活性形式是1,25-(OH)2-D3 3. 维生素B1活性形式是TPP 4. 维生素B2的活性形式是FMN和FAD 5. 维生素PP的活性形式NAD+和NADP+ 6. 维生素B6的活性形式是磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺 7. 四氢叶酸(FH4)是一碳单位转移酶的辅酶,53,3作用机制、动力学、抑制的类型和特
20、点。 机制:降低反应的活化能 (1)诱导契合学说;(2)邻近效应;(3)定向作用; (4)多元催化;(5)表面效应。 特点:(1)催化效率高; (2)高度特异性;绝对特异性 相对特异性 立体结构特异性 (3)可调节性,54,动力学: (1)作用物浓度的影响 Vmax S V= - Km + S,米式常数的意义 (1)Km是速度为最大反应速度一半时的S (2)Km反映酶与作用物的亲合力,Km大,亲合力小;Km小,亲合力大。 酶的特征性常数。,55,(2)酶浓度的影响:V与酶浓度成正比。 (3)pH的影响:最适pH酶活性最大时的pH。 (4)温度的影响:最适温度。 (5)激活剂: (6)抑制剂:,
21、抑制类型及特点:可逆抑制 (1)竞争性抑制: 特点:Km, Vmax 不变 (2)非竞争性抑制: 特点:Km不变, Vmax (3)反竞争性抑制: 特点:Km, Vmax,57,不可逆性抑制 1.概念: 抑制剂与酶以共价键结合使酶失去活性,不能用透析法除去抑制剂使酶活性恢复。 2.抑制作用特点: 不可逆性抑制,抑制剂浓度越高,抑制作用时间越长,抑制作用越强。 3. 不可逆性抑制举例 有机磷农药中毒-“胆碱酯酶”,58,酶的调节 1酶原的激活原理 酶原:由细胞合成分泌尚不具有催化活性的酶的前体,经加工使酶原的活性中心暴露或者形成,变成活性酶的过程为激活。,机理:切除部分肽段, 改变分子构象、 暴
22、露或形成活性中心。,2同功酶,变构酶 同功酶:分子结构不同,理化性质及免疫性质不同,但具有相同的催化作用。例如:乳酸脱氢酶(LDH)。 变构酶:小分子与酶的调节亚基结合,使酶构象改变,而影响酶活性。,变构效应:调节亚基和变构剂(体内一些小分子代谢物)结合后,使酶的空间构象改变,从而影响酶活性(增高或降低)的现象,称,或别构效应。这类可被别构剂调节的酶称别构酶。 别构酶是体内快速调节酶活性的重要方式,在代谢调节中多为关键酶。,60,A型题,28、下列关于辅酶与辅基叙述错误的是? A. 一种辅酶或辅基可以与多种酶蛋白结合 B. 酶蛋白的功能是决定反应的特异性 C. 辅酶的功能是参与酶促化学反应 D
23、. 一种辅酶或辅基只能与一种酶蛋白结合,61,27下列关于酶的Km值的叙述,正确的是 D A是反应速度达到最大速度时的底物浓度 B不能反映酶对底物的亲和力 C对有多个底物的酶,其Km 值相同 D对同一底物,不同的酶有不同的Km值 【分析】酶的Km 值等于酶促反应速度为最大速度一半时的底物浓度,反映酶对底物的亲和力,Km值愈小,酶与底物的亲和力愈大。其特点是对有多个底物的酶,其Km值不相同,而对同一底物,不同的酶有不同的Km值,故正确答案是D。,62,X 型题:,133 酶与一般催化剂相比,不同点有 A反应条件温和,可在常温、常压下进行 B加速化学反应速度,可改变反应平衡点 C专一性强,一种酶只
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